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教师简历
教师简历
               
牛登科   (1971年10月)  
博士 教授  
E-mail:dkniu@bnu.edu.cn  
个人主页:http://cmb.bnu.edu.cn/teachers/niudk.htm
  
个人简历

      2008年7月至今,新京澳门葡萄城,教授。

      2003年8月至2008年6月,新京澳门葡萄城,副教授。

      2001年11月至2003年8月,新京澳门葡萄城生态研究所,博士后研究。

      2000年9月至2001年8月,法国图卢兹第三大学CESAC实验室,博士后。

      1999年7月至2001年11月,中国科新京澳门葡萄城水生生物研究所,博士后研究。

      1996年9月至1999年7月,武汉大学新京澳门葡萄城植物学专业,博士。

      1993年9月至1996年7月,兰州大学生物学系细胞生物学专业,硕士。

      1989年9月至1993年7月,河北大学生物学系微生物及生化专业,学士。

主要研究内容

微生物基因组进化,包括探究影响原核生物的CRISPR-Cas等防御系统进化的生理、生态和遗传因素。

氧气、干旱等生境条件对基因组进化的影响,包括自由基对遗传物质的损伤、GC含量、密码子偏好、基因组大小等。

内含子和基因组大小进化,包括内含子存在的代价和带来的好处、进化历史上基因丢失和获得内含子的机理,基因组大小的主要贡献组分(内含子和基因间隔序列、转座子、假基因等)存在的利弊,或是既无利也无弊;基因组大小是否与细胞大小、生长发育速度、代谢速率、个体大小等表型特征存在相关性,如果存在,背后的生物学机理是什么?即基因组大小怎样影响这些表型。

代表性研究成果

Research Article(研究性论文)

1. Hu EZ, Lan XR, Liu ZL, Gao J, Niu DK. A positive correlation between GC content and growth temperature in prokaryotes. BMC Genomics 2022; 23, 110.

2. Lan XR, Liu ZL, Niu DK. Precipitous increase of bacterial CRISPR-Cas abundance at around 45°C. Frontiers in Microbiology 2022; 13: 773114.

3. Ma MY, Xia J, Shu KX, Niu DK. Intron losses and gains in the nematodes. Biol Direct 2022; 17: 13.

4. Zhu T, Niu DK. Frequency of intron loss correlates with processed pseudogene abundance: a novel strategy to test the reverse transcriptase model of intron loss. BMC Biol. 2013; 11: 23.

5. Hou WR, Li M, Niu DK. Counting citations in texts rather than reference lists to improve the accuracy of assessing scientific contribution. BioEssays. 2011; 33: 724-7.

6. Niu DK, Hou WR, Li SW. mRNA-mediated intron losses: evidence from extraordinarily large exons. Mol Biol Evol. 2005; 22: 1475-81.

Comment(观点)

1. Niu DK, Jiang L. Can ENCODE tell us how much junk DNA we carry in our genome? Biochem Biophys Res Commun. 2013; 430: 1340-3

2. Niu DK. Protecting exons from deleterious R-loops: a potential advantage of having introns. Biol Direct. 2007; 2: 11.

3. Niu DK, Chen JK. Evolutionary advantages of cell specialization: Save and protect DNA. J Theor Biol. 1997; 187: 39-43.


 

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