1
分子生态学
利用DNA、RNA、蛋白质水平上的分子标记技术，研究物种协同进化、生物入侵、物种形成、动植物繁殖等方面的生态与进化问题。
2
生理生态学
研究环境对动物生理功能的影响以及生物体对胁迫等环境适应的生理、生化与分子机制。采用分子、生理、生化与生态学研究方法和理论探讨生物胁迫响应的机理。
3
种群生态学
采用宏观与微观相结合的手段，对种群数量及其分布开展评估与监测，对其动态及其趋势进行预测，同时研究亲缘地理学，探讨珍稀濒危物种保护以及有害物种防治的相关科学问题。
4
群落与生态系统生态学
研究现有生物多样性的分布格局、关键环境因子对群落中物种组成以及遗传多样性的影响，分析生物多样性与生态系统功能之间的相关性、自然群落生物多样性的形成与维持与环境变迁的关系，以期揭示生物多样性的形成与维持机制。
5
景观生态学与生态工程
研究空间格局、生态过程和功能的相互关系，侧重空间异质性、干扰动态、尺度推译、景观格局分析等大尺度生态学问题。同时关注生态恢复、生态系统管理、生物多样性保护等应用性问题。
6
植物多样性与生态学
研究植物系统发育、物种形成和演化、演替以及植物与环境间相互关系，并从植物亲缘地理学等角度揭示植物类群的起源、演化和扩散机制。同时基于特定的植物类群，探讨基因和基因家族的进化式样和规律。
7
水生生物生态学
研究水生态系统中重要类群的遗传多样性分布格局、系统发生关系、种群的历史动态等，以全面深入地理解物种遗传多样性的保持机制及其在生物进化过程中发挥的作用。
8
行为生态学
主要研究生态学中的行为机制和动物行为的生态学意义和进化意义。包括觅食行为、筑巢行为、防御行为、领域行为、求偶行为、生殖行为、社会行为、学习行为、通讯行为、时空行为等内容。
9
生物信息学
关注如何有效并且正确地分析高通量测序技术所产生的海量数据，包括相关算法的开发和改进、复杂数据分析流程的平台建立及其优化、以及特定科学实验所产生数据的整合分析。
10
进化生物学
研究适用于多个类群的具有普遍性的基本理论、现象和规律，如分子进化、基因组进化、物种间协同进化、入侵生物对新环境所产生的适应性进化及快速进化等。
